木耳是鲜为人知的美味，新鲜的木耳不易保存，所以现在人们一般都将木耳晒干或风干后储存，及时这样也不可长时间储藏，所以木耳也是有保质期的。

木耳的储藏适温为0℃，相对湿度95%以上为宜。因它是胶质食用菌，质地柔软，易发黏成僵块，需适时通风换气，以免霉烂。木耳贮藏保鲜的难度较大，即使在适宜的温、湿度环境条件下，也只能贮藏2―3周，故不宜久贮，只作周转运输性的短期保鲜运贮。需采用筐、 箱或塑料袋包装。

黑木耳干货放置在阴凉处保存是没问题的，但是久泡的黑木耳不能吃了。耳本身无毒，但是久泡后可能会变质产生类似的生物毒素，或滋生细菌、真菌等致病微生物。如果室内温度在20℃以上，特别是夏季高温，木耳变质的速度非常快。当发泡时间超过8小时，变质所导致的细菌量将达到原来的数倍至几十倍，就有可能生成毒素。